黃緣盒龜屬半水棲龜類，不能生活在深水域內。在人工飼養的條件下，4～5月和9～11月氣溫達18～～22℃時，龜早晚活動較少，中午前后活動較多；每年的6～8月氣溫25～34C，龜以夜間、清晨或傍晚活動為主，白天隱蔽在洞穴、樹木或沙土中。

若遇雨季，則常到洞外淋雨。12月至翌年1～3月，是龜的冬眠期。當溫度19°C時，龜停食；1氣溫下降到10°C左右，龜進入冬眠。冬眠時，喜躲在洞穴、樹枝堆或在較厚的枯萎草層下，且大多在向陽、背風處。當氣溫在13℃時，龜又蘇醒。

黃緣盒龜的身體結構較其他的龜類特殊。其背甲與腹甲間、腹盾與胸盾間均以韌帶相連。故龜在遇到敵害侵犯時，可將它夾死或夾傷，如蛇、鼠等動物，也可將自身縮入殼內，不露一點皮肉，使敵害無從下手。黃緣盒龜較其他的淡水龜類膽大，不畏懼人，同類很少爭斗。